河北大学构建燕麦超级泛基因组

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关键词：

来源：

Nature Genetics

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//agri.nais.net.cn/topic/downloadFile/dd00d328-b693-4293-ac06-6e9756fd6d38

来源地址：

https://doi.org/10.1038/s41588-025-02294-z

资源所属：

农业生物技术专题

类型：

学术文献

语种：

英语

原文发布日期：

2025-08-20

摘要：

2025年8月20日，来自河北大学、中国农业大学等机构的杜会龙、何强、龚志忠等研究团队在《Nature Genetics》上发表题为《Super-pangenome analyses across 35 accessions of 23 Avena species highlight their complex evolutionary history and extensive genomic diversity》的研究论文。该研究构建了包含23个燕麦属物种、35个高质量基因组的属级超级泛基因组，其中包括14个栽培燕麦和21个野生燕麦材料，全面解析了燕麦属的进化历史、基因组多样性和结构变异（SVs）对逆境适应的调控机制。通过系统发育分析，研究明确了多倍体燕麦亚基因组的起源与演化路径，尤其是澄清了B亚基因组的早期分化地位，并修正了Avena agadiriana的分类（实为AcAcAsAs型而非AABB型）。超级泛基因组分析揭示野生燕麦贡献了26.63%的新基因家族和59.93%的新单倍型，显著丰富了遗传资源。研究还整合了1,401个RNA-seq样本，发现SVs广泛影响基因表达，尤其在逆境响应中起关键作用；通过SV-GWAS鉴定出13个与抗旱相关的候选基因（如AsARF7），并利用转基因燕麦株系验证了其功能。该研究为燕麦基因组学、进化研究和分子育种提供了宝贵的资源与理论基础。