意大利巴里大学建立RNA A-to-I编辑研究综合性数据库REDIportal

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关键词：

来源：

Nucleic Acids Research

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//agri.nais.net.cn/topic/downloadFile/c9db489a-918d-4203-81bc-58d6ba9bc8b5

来源地址：

https://doi.org/10.1093/nar/gkae1083

资源所属：

农业生物技术专题

类型：

学术文献

语种：

英语

原文发布日期：

2024-11-26

摘要：

2024年11月26日，Nucleic Acids Research在线发表了意大利巴里大学Ernesto Picardi团队的最新研究进展：“REDIportal: toward an integrated view of the A-to-I editing”。该研究建立了专门用于RNA A-to-I编辑研究的综合性数据库—REDIportal，该数据库收集了约1600万个来自GTEx和TCGA项目的RNA编辑位点，不仅提供了编辑位点的精确定位和注释信息，还支持编辑位点的检索、可视化以及双链RNA分析功能。它通过与Ensembl、UniProt、RNAcentral和PRIDE等重要数据库的整合，提供了丰富的数据关联信息，并配备了基于深度学习的可靠性评分系统。此外，它还包含了重要的分析指标如AEI和REI，为研究人员提供了一个强大的工具来研究RNA编辑在人类生理和疾病中的作用。总的来说，REDIportal为RNA编辑研究提供了一个全面而强大的参考数据平台。通过整合大规模的编辑位点数据和多维度的分析工具，它不仅帮助研究人员更好地理解RNA编辑在人类生理过程中的作用，还为研究RNA编辑与各种疾病（如神经退行性疾病、自身免疫疾病和癌症）的关联提供了重要支持。特别是在个性化医疗方面，该数据库为开发基于RNA编辑的治疗策略和生物标志物的发现提供了重要的数据基础，这对于推进RNA编辑在临床应用中的转化具有重大意义。