中科院天津工业生物所开发面向CRISPR技术的基因组编辑自动化设计在线工具AutoESDcas

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来源：

中科院天津工业生物所

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//agri.nais.net.cn/topic/downloadFile/9cd7d8cf-557f-4326-b538-e76e676272b0

来源地址：

http://www.tib.cas.cn/xwzx_104015/kyjz/

资源所属：

饲料用酶工程

类型：

前沿资讯

语种：

中文

原文发布日期：

2024-06-18

摘要：

近日，中国科学院天津工业生物技术研究所生物设计中心平台实验室开发了面向CRISPR技术的基因组编辑自动化设计在线工具AutoESDcas（https://autoesdcas.biodesign.ac.cn）。该工具面向CRISPR介导的同源重组技术和Golden Gate组装技术，通过搭建自动化编辑序列设计流程，实现了基因组编辑的自动化和高通量设计；通过整合多种基因组编辑任务的设计流程，实现了对多种基因组编辑实验场景的支持；通过添加同源臂脱靶风险评估和基于脱靶分析的引物优化功能，提高了设计结果的可靠性。该工具能够自动化完成针对不同实验场景的基因组编辑实验流程所需的全套编辑序列设计。针对多个物种的数百个设计任务可在一小时内完成，尤其适用于面向高通量基因编辑平台的大规模基因组编辑设计。