中科院天津工业生物所开发定量异源途径设计方法,助力微生物产品合成途径的高效设计
- 关键词:
- 来源:
- 中国科学院天津工业生物技术研究所
- 类型:
- 前沿资讯
- 语种:
- 中文
- 原文发布日期:
- 2024-10-22
- 摘要:
- 中国科学院天津工业生物技术研究所生物设计中心开发了一个定量异源途径设计方法QHEPath。利用该方法,研究团队系统地评估了五种常用工业微生物在四种底物下合成300种生化产品的12,000个生物合成场景。结果表明,超过70%产品途径的理论得率有潜力通过引入合适的异源反应得到提升。同时,团队还总结了13种通用的途径优化策略,这些策略主要分为碳节约和能量节约两大类,其中五种策略对100多种产品的得率提升均有效。为了使生物学家能够更便捷地应用这一方法,团队还搭建了一个在线异源途径设计平台QHEPath (https://qhepath.biodesign.ac.cn/)。该平台能够定量计算并可视化35种微生物宿主中产品的高得率合成途径,并且成功预测了文献中多种产品的途径优化策略。
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