同济与上交合作开发支持群体分组分析的宏基因组测序综合分析软件

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关键词：

来源：

iMetaOmics

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//agri.nais.net.cn/topic/downloadFile/685d5f4a-82d1-423e-8001-efa19cad8c74

来源地址：

https://doi.org/10.1002/imo2.29

资源所属：

农业生物技术专题

类型：

学术文献

语种：

英语

原文发布日期：

2024-09-18

摘要：

2024年9月18日，同济大学李江涛、魏珂联合上海交通大学王晓竹等团队在iMetaOmics在线发表了题为“OUTPOST: a comprehensive analysis software for whole-metagenome shotgun sequencing incorporating group stratification”的文章。本文开发了针对宏基因组鸟枪法测序的综合分析软件OUTPOST，OUTPOST（the whole metagenOme shotgun seqUencing sTream Pipeline that is cOmprehensive and uSeful for mulTi groups experiments）是一个针对宏基因组鸟枪法测序的综合分析软件，同时包含了群体分组分析。它包括14个模块，拥有超过50个功能，与现有的17种宏基因组鸟枪法测序（whole-metagenome shotgun sequencing，WMGS）工具相比，因其全面性而脱颖而出。OUTPOST为多组实验设计和基于荟萃分析的生物标志物鉴定引入了创新方法。