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麻省理工开发用于体内持久表观基因组编辑的IscB进化用于指导蛋白质设计

关键词:
来源:
Nature Biotechnology
来源地址:
https://doi.org/10.1038/s41587-025-02655-3
类型:
学术文献
语种:
英语
原文发布日期:
2025-05-07
摘要:
2025年5月7日,美国麻省理工学院张锋团队在《Nature Biotechnology》在线发表题为“Evolution-guided protein design of IscB for persistent epigenome editing in vivo”的研究论文,该研究开发了用于体内持久表观基因组编辑的IscB进化用于指导蛋白质设计。在这里,研究人员通过结合直向同源筛选、结构指导的蛋白质结构域设计和RNA工程以及基于深度学习的结构预测,设计了紧凑的专性可动因子指导活性(OMEGA) RNA指导的核酸内切酶IscB及其指导RNA (ωRNA),以产生改进的变体NovaIscB。研究发现紧凑的NovaIscB在人类基因组上实现了高达40%的indel活性(比野生型OgeuIscB提高了约100倍),相对于现有的IscB具有更高的特异性。进一步表明,NovaIscB可以与甲基转移酶融合,产生可编程转录阻遏物OMEGAoff,它足够紧凑,可以包装在单个腺相关病毒载体中,用于持续的体内基因阻遏。这项研究强调了将天然多样性与蛋白质工程相结合来设计用于分子生物学应用的增强型酶的力量。
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