美国加利福尼亚大学等合作开发Context-Seq技术

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关键词：

来源：

Nature Communications

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来源地址：

https://www.nature.com/articles/s41467-025-60491-0

资源所属：

农业生物技术专题

类型：

学术文献

语种：

英语

原文发布日期：

2025-07-03

摘要：

2025年7月3号，来自美国华盛顿大学、加利福尼亚大学伯克利分校、肯尼亚医学研究所等机构的研究团队在《Nature Communications》发表题为《Context-Seq: CRISPR-Cas9 targeted nanopore sequencing for transmission dynamics of antimicrobial resistance》的论文。该研究开发了 Context-Seq 技术，利用 CRISPR-Cas9 靶向测序抗生素耐药基因（ARGs）及其基因组背景。通过在肯尼亚内罗毕收集的人类（成人和儿童）、家禽和犬类粪便样本，检测 blaCTX-M 和 blaTEM 基因，发现动物和人类之间存在遗传上 distinct 的 blaTEM 和 blaCTX-M 群集，并鉴定出潜在的致病宿主，包括大肠杆菌、肺炎克雷伯菌和流感嗜血杆菌。研究显示，blaCTX-M 主要在大肠杆菌和肺炎克雷伯菌的质粒上共享，而 blaTEM 则在大肠杆菌、肺炎克雷伯菌和流感嗜血杆菌之间共享。Context-Seq 技术为研究 AMR 提供了一个有力工具，有助于识别重要的传播途径，支持 “一个健康” 框架下的 AMR 控制策略。