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科学家发展AI赋能的蛋白质理性设计新方法

关键词:
来源:
科学网
来源地址:
https://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/2024/12/2024122413485693125960.shtm
类型:
前沿资讯
语种:
中文
原文发布日期:
2024-12-24
摘要:
华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室教授郁惠蕾、许建和团队,利用人工智能(AI)赋能的蛋白质理性设计技术重塑了羧酸还原酶的活性中心,大幅提升羧酸还原酶的活性和底物专一性,并成功应用于尼龙6和尼龙66的单体(1,6-己二胺和6-氨基己酸)的生物合成中。相关研究发表于《科学进展》。 研究团队发展了AI赋能的蛋白质理性设计新方法,构建了基于近攻击构象概率和酶-底物结合能的物理模型,并利用Rosetta Design对活性中心多个位点的庞大组合突变体库进行了高效精准的设计和评价,实现了酶活性中心大范围协同突变的“功能重塑”。实验结果显示,人工设计的突变体酶对底物6-氨基己酸的催化效率提升101倍,对底物1,6-己二酸的催化效率提升14倍且底物专一性提高86倍。最终,由1,6-己二酸出发合成的尼龙前体6-氨基己酸和1,6-己二胺,生产强度分别达到文献报道最高值的13.3倍和12倍。
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