PRRSV利用多变B-TRS高效转录亚基因组的独特机制研究

基金项目类型：

国家自然科学基金

基金项目编号：

31672581

来源网站：

国家自然科学基金委员会

来源网址：

http://www.nsfc.gov.cn/

负责人：

王兴龙

完成单位：

西北农林科技大学

中文关键词：

猪繁殖与呼吸综合征; 病毒; 亚基因组RNA; 转录; 转录调控序列;

项目类型：

面上项目

语种：

中文

开始日期：

2017-01-01

结束日期：

2020-12-31

中文摘要：

多数套式病毒目病毒借助保守的转录调控序列（TRS）转录出亚基因组（sgRNA），以提高基因组利用效率和增殖速度。前期分析I型PRRSV转录组时却发现其sgRNA TRS异常多变。依据sgRNA转录理论，突变TRS会降低转录效率，但近年来出现的PRRSV变异株，TRS变异度增加，增殖速度却更快。为解释这一现象，我们提出了PRRSV 非连续sgRNA的连续转录和L-TRS辅助B-TRS转录的假说，建立了一种新的半连续转录(QMSS)模型。项目将用高通量测序分析单、共感染PRRSV sgRNA转录谱，解答连续性转录的问题；通过构建L-TRS缺失体、RNA Pull-Down和酵母三杂交试验分析L-TRS的作用及其工作模式；通过反向遗传操作和过表达试验解析调控sgRNA转录量的机制。最终验证模型，揭示PRRSV利用多变B-TRS 高效转录的独特机制，为理解PRRSV高效增殖和快速变异特性提供依据。