猪重要免疫应答性状的全基因组关联研究

基金项目类型：

国家自然科学基金

基金项目编号：

31072009

来源网站：

国家自然科学基金委员会

来源网址：

http://www.nsfc.gov.cn/

负责人：

樊斌

完成单位：

华中农业大学

中文关键词：

免疫应答; 全基因组关联; 基因通路; 干扰素α; 基因功能;

其他语种关键词：

Immune response; genome-wide association study; gene network; Interferon α; gene function

项目类型：

面上项目

语种：

中文

开始日期：

2011-01-01

结束日期：

2013-12-31

中文摘要：

动物对外界刺激所产生的免疫应答是其抗病能力的一种体现。本项目拟利用本实验室已构建的用于猪重要免疫应答相关性状QTL定位的杜洛克×二花脸资源家系，根据F2个体35日龄经病毒模拟物Poly (I:C) 刺激后测得的抗体数据，选择两尾表型个体分为Case组（n=60）和Control组（n=60），采用猪全基因组60K SNP芯片进行基因型检测，使用case-control法及新近发展的贝叶斯方法开展全基因组关联分析；依据关联显著SNPs选取候选基因和基因组区域，在这些特定区域内搜寻新SNPs，制备Sequenom芯片，对F2个体及其它实验群体进行分型和关联分析，进一步验证关联结果；借助定量RT-PCR和RNAi实验技术研究候选基因功能。研究结果可望挖掘出一批与猪免疫应答相关的候选基因和基因组候选区域，探索基因间生物学作用途径和网络，为猪的分子抗病育种的深入研究提供新的资料和科学依据。