动物梨形虫条形码基因的挖掘与DNA分类工具的建立

基金项目类型：

国家自然科学基金

基金项目编号：

30972182

来源网站：

国家自然科学基金委员会

来源网址：

http://www.nsfc.gov.cn/

负责人：

罗建勋

完成单位：

中国农业科学院兰州兽医研究所

中文关键词：

梨形虫; 分子分类; DNA条形码; 系统发育分析; 协同进化;

其他语种关键词：

Piroplasma; Molecular taxonomy; DNA barcoding; Phylogenetic analyses; Coevolution

项目类型：

面上项目

语种：

中文

开始日期：

2010-01-01

结束日期：

2012-12-31

中文摘要：

本实验室2006年-2008年所承担的国家自然科学基金项目（30571397）曾对依托于我单位的中国兽医微生物菌种保藏中心原虫分中心内收藏的20多种30余株兽医原虫的18SrRNA和ITS1-5.8S-ITS2基因区段的序列进行了分析比较，并对它们充当分子标志的特点进行了讨论，以这些分子为靶标建立了PCR、LAMP、RLB等分子检测方法，试验证实它们均具有一定应用价值。本研究旨在已有工作的基础上，结合国际生物条形码计划的最新研究成果，继续对线粒体COⅠ和Cyt b、28S rRNA、裂殖子表面蛋白（MSP）等基因进行测序，利用生物信息学手段对每个基因隐含的条形码信息进行分析，在国际上首先提出适合作为动物梨形虫DNA条形码的最佳基因；以条形码基因为靶标，分别设计一系列针对科、属、种等分类阶元特异的核酸探针，建立可用于动物梨形虫分类的虚拟DNA芯片和DNA芯片，为病原分类和疾病诊断提供工具。