The present invention relates to a device for removing bad smell of a pigpen and a method thereof capable of increasing air purification efficiency of the animal dung of the pigpen and building an eco-friendly pigpen environment. The device for removing the bad smell of the pigpen comprises an enclosed collection line (110), a center collector (120), an air cooling cleaner (130), a water cooling cleaner (140), and a discharging device (150). The enclosed collection line (110) firstly collects the gas of the dung and moves the same through a pipe (102) and a ventilator (104). The center collector (120) secondly collects the gas of the animal dung. The air cooling cleaner (130) firstly cleans the gas collected by the center collector (120). The water cooling cleaner (140) secondly cleans the gas with a microbial agent comprising a hyphomicrobium denitrifican culture medium by using a plurality of spray nozzles (142). The discharging device (150) discharges the gas to the room temperature.본 발명은 돈사(豚舍)에서 발생하는 가축분뇨에서의 공기정화 효율을 증대시키고 친환경 축산환경을 이루수 있는 돈사의 공기정화 장치 및 방법에 관한 것이다.본 발명에 따른 돈사의 공기정화 장치는, 각 돈사(100)에서 배출되어 슬러리 피트(slurry pit)에 수거된 가축분뇨중의 가스를 1차 포집하여 배관(102) 및 환풍기(104)를 통해 이동시키는 밀폐형 포집라인(110); 상기 이동된 가축분뇨중의 가스를 2차 포집하는 중앙 포집기(120); 상기 중앙 포집기(120)에 의해 포집된 가스를 1차 세정하는 공냉식 세정기(130); 상기 1차 세정을 거친 가스를 다수의 분사노즐(142)을 통해 하이포마이크로비윰 다니트리피칸스(Hyphomicrobium denitrificans) 균주 배양액을 포함하는 미생물제제로 2차 세정하는 수냉식 세정기(140); 및 상기 수냉식 세정기(140)를 거친 가스를 상온 배출하는 배출기(150)를 포함하여 구성된다.