本发明提供了一种转Cry1Ab抗虫基因水稻品系mfb-MH86的检测方法。所述方法是转化体mfb-MH86中外源基因Cry1Ab表达框在水稻染色体上插入片段及其5’端旁侧特异序列SEQ ID NO:1和3’端旁侧特异序列SEQ ID NO:2,以及基于这2段序列建立的特异性PCR扩增鉴定技术。PCR所用LB端正向引物依据SEQ ID NO:1中1-390位序列设计,反向引物依据SEQ ID NO:1中391-2000位序列设计;PCR所用RB端正向引物依据SEQ ID NO:2中1-1300位序列设计,反向引物依据SEQ ID NO:2中1301-2000位序列设计。该PCR方法可作为特异性鉴定转基因水稻品系mfb-MH86及该品系的衍生系的有效手段。