番茄RAV基因家族鉴定及生物信息学分析

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作   者：

王婷;  孙虹;  任仲海;  李强; 

作者机构：

山东农业大学园艺科学与工程学院; 

关键词：

RAV基因家族;  番茄;  共线性分析; 

期刊名称：

分子植物育种

i s s n：

年卷期：

2023 年 006 期

页   码：

1793-1800

摘   要：

RAV （Related to ABI3/VP1）基因是植物特有的转录因子，在调控胁迫响应和生长发育等过程中起着重要作用。为了明确番茄RAV基因家族成员并为其功能研究奠定基础，本研究在番茄全基因组范围内鉴定了RAV基因并对其进行系统的生物信息学分析。结果表明，番茄中有9个RAV家族基因，可以分为4个分支且同一分支内的基因结构和结构域相对保守。番茄、水稻和拟南芥RAV基因的同源进化关系、基因结构和保守基序分析结果表明，3个物种中的RAV基因的进化相对保守，预示着其功能的相似性。共线性分析结果表明，片段复制事件对番茄RAV基因家族的进化和扩张起着重要作用。与水稻RAV基因相比，番茄和拟南芥的RAV基因的进化关系更近。顺式作用元件分析表明，番茄RAV可能通过参与激素代谢参与逆境胁迫和生长发育等生物学过程。本研究结果揭示了番茄、拟南芥和水稻RAV基因的同源进化关系和番茄RAV基因的潜在功能，为进一步研究番茄RAV基因的生物学功能提供理论基础。