基于WGCNA联合Lasso回归构建结直肠癌ICI治疗预测标志物并验证

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作   者：

张虎;  吴红雁;  赵小芳;  杜欣娜; 

作者机构：

江苏医药职业学院基础医学部生理生化教研室; 

关键词：

加权基因共表达网络分析(WGCNA);  Lasso-Cox回归;  结直肠癌(CRC);  免疫检查点抑制剂(ICI)治疗; 

期刊名称：

中国老年学杂志

i s s n：

1005-9202

年卷期：

2025 年 45 卷 006 期

页   码：

1296-1302

摘   要：

目的 构建一种结直肠癌(CRC)免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的预测标志物并验证。方法 首先利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)获得CRC免疫浸润相关基因模块。然后，利用单因素生存分析和Lasso-Cox回归构建CRC预后标签及其风险分数的计算公式，并利用Kaplan-Meier和受试者工作特征(ROC)曲线评估该标签预后效能。接下来，利用肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)在线工具评估各CRC数据集的免疫治疗效果，分析标签风险分数对上述治疗的预测作用。最后，基因集富集分析(GESA)被用于分析预后标签的潜在分子机制。结果 WGCNA筛选获得了免疫相关模块基因614个，其中63个基因与CRC预后有关(均P<0.05)。Lasso-Cox回归构建了一个包含17个基因的预后标签，低风险组CRC患者总体预后显著优于高风险组(P<0.001),且预后敏感度和特异度较高。进一步地，ICI治疗预测显示GSE39582中低风险组响应率显著高于高风险组(P<0.001),4个外部数据集验证结果均显示，低风险组ICI治疗响应率显著高于高风险组(P<0.001,P<0.05)。最后，GSEA显示G2M检查点、HEDGEHOG信号通路、干扰素反应、缺氧和上皮间质转化等信号通路可能介导预后标签调节免疫的功能。结论 基于免疫相关基因构建的预后模型不仅可以有效预测CRC患者总体生存率，还可以预测免疫治疗疗效。