基于SNP分子标记的福建玳瑁山脉茶树种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

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作   者：

贵文静;  于文涛;  刘玲玉;  罗华标;  罗钦;  朱艳宇;  王攀;  蔡春平;  叶乃兴; 

作者机构：

福建农林大学园艺学院; 

关键词：

亲缘关系;  遗传多样性;  茶树;  SNP分子标记;  玳瑁山脉; 

期刊名称：

南方农业学报

i s s n：

2095-1191

年卷期：

2025 年 56 卷 001 期

页   码：

160-168

摘   要：

【目的】分析福建玳瑁山脉茶树种质资源的亲缘关系和遗传多样性，并构建其DNA指纹图谱，为玳瑁山脉茶树种质资源的保护、鉴定和利用提供参考依据。【方法】利用SNP分子标记对83份玳瑁山脉茶树种质资源进行亲缘关系和遗传多样性分析。利用GenAlEx 6.503计算遗传距离，并进行主坐标分析（PCoA）。运用MEGA 5.05和DARwin 6.0构建层次聚类树。利用Structure 2.3.4进行群体结构分析，使用Clumpp 1.1.2和Distruct 1.1绘制种群结构图，并构建DNA指纹图谱。【结果】从83份玳瑁山茶树种质资源中筛选出51个多态性高的SNP位点，用于鉴定玳瑁山脉茶树种质资源的基因分型。83份玳瑁山茶树种质资源的Shannon’s信息指数（I）平均为0.530，观测杂合度（Ho）平均为0.312，期望杂合度（He）平均为0.352，固定指数（F）平均为0.122，次等位基因频率（MAF）平均为0.261。83份玳瑁山脉茶树种质资源可分为4个产区，基本上每个产区茶树种质均可单独聚为组群，新罗产区和漳平产区的茶树种质各自较独立聚集，上杭产区和连城产区的茶树种质交流较密切。不同产区种群间遗传分化系数（Fs）t为0.090～0.165，属于中度遗传分化，上杭产区与漳平产区的茶树群体间Fst最大，为0.165，遗传距离最大，为0.189，茶树基因型差异最大，亲缘关系较远，种群间分化较明显；上杭产区与连城产区的茶树群体间遗传距离最小，为0.082,Fst最小，为0.090，茶树种质基因型最相近，遗传物质交流最频繁。通过51个有效SNP位点的基因分型，将其扩增位点信息连锁编码构建的DNA指纹图谱，可有效对玳瑁山脉茶树种质资源进行区分。【结论】玳瑁山脉茶树种质资源具有丰富的遗传多样性，利用筛选出的SNP分子标记可有效鉴定玳瑁山脉茶树种质资源的亲缘关系，可用于玳瑁山脉茶树种质资源鉴定及保护。