不同泌乳期牦牛乳腺组织的转录组学分析

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作   者：

董宝霞;  杨玉莹;  俞红贤;  张勤文;  高小龙;  李莉;  魏青;  荆海霞; 

作者机构：

青海大学生态环境工程学院;  青海大学农牧学院; 

关键词：

差异表达基因;  牦牛;  乳腺;  转录组;  不同泌乳期; 

期刊名称：

中国畜牧杂志

i s s n：

0258-7033

年卷期：

2022 年 58 卷 004 期

页   码：

89-98

摘   要：

本文旨在探讨不同泌乳期内牦牛乳腺组织的转录组差异,筛选并分析有关的差异基因,为后续牦牛的泌乳及其相关调控机制的研究提供一定的参考资料.实验采集处于泌乳早期、泌乳中期及干奶期的牦牛乳腺组织并提取总RNA,用RNA-Seq对不同泌乳期的牦牛乳腺组织进行转录组测序并分析.结果显示,通过对转录组数据进行比较分析,共筛查出3812个差异表达基因(FDR<0.05),其中2907个表达上调,905个表达下调.GO功能分析表明,很多差异表达基因与多种物质代谢相关的生物学过程密切相关.干奶期和泌乳早期、干奶期和泌乳中期、泌乳中期和泌乳早期乳腺组织中差异表达基因各有3137、394、281个.KEGG通路分析显示,干奶期vs泌乳早期、干奶期vs泌乳中期、泌乳中期vs泌乳早期中注释到KEGG的显著富集通路分别有29、15、22条(P<0.05),主要有味觉传导、ECM受体相互作用、卵巢类固醇生成等.通过对泌乳早期、泌乳中期和干奶期牦牛乳腺组织转录组数据的对比分析,筛选并分析出相关差异表达基因,为挖掘牦牛泌乳调控和乳腺发育相关候选基因提供了基础数据,为进一步研究牦牛泌乳调控机制提供新的思路.