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大豆球蛋白A1a亚基同源建模及抗原表位的预测
- 作 者:
-
付杨;
席俊;
陈慧彬;
陈阳;
- 作者机构:
-
河南工业大学粮油食品学院;
- 关键词:
-
大豆球蛋白A1a亚基;
生物信息学;
同源建模;
线性表位;
构象表位;
- 期刊名称:
- 食品与发酵工业
- i s s n:
- 0253-990X
- 年卷期:
-
2022 年
48 卷
008 期
- 页 码:
- 22-27
- 摘 要:
-
为探究大豆球蛋白A1a(Glycinin A1a)亚基的线性B细胞表位,在美国国家生物信息技术中心(National Center of Biotechnology Information,NCBI)数据库中索引到Glycinin A1a亚基的氨基酸序列,利用一系列生物信息软件对该亚基进行一级结构、二级结构分析,预测出的线性B细胞表位为24 EQPQQN29、40 KPDNRI45、56 NPNNK60、80 RRPSYTNG87、114 PQQPQQRGQS123、197 QEQGGHQSQKGKHQQEEENE216、247 NEGED251、267 PPTDEQQQRP276、285 DEK-PQCKGK293、299 RPRGS303.再使用SWISS-MODEL对Glycinin A1a亚基的三级结构完成同源建模,使用DiscoTope 2.0 Server对大豆球蛋白A1a亚基进行构象表位预测.这为进一步探究大豆致敏表位缩小了范围,为后期大豆球蛋白A1 a亚基过敏原检测提供参考.
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