应用3种遗传分析方法分析养殖鲤与天然群体的遗传差异

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作   者：

许丽花;  李巍;  吴春琳;  董在杰;  王成辉; 

作者机构：

上海海洋大学; 

关键词：

主成分分析;  贝叶斯遗传重排技术;  鲤;  贝叶斯遗传聚类分析;  微卫星标记; 

期刊名称：

浙江大学学报(农业与生命科学版)

基金项目：

i s s n：

1008-9209

年卷期：

2012 年 38 卷 04 期

页   码：

393-399

摘   要：

应用基于分子标记的主成分分析法、贝叶斯遗传聚类法和遗传重排技术对鲤4个人工选育群体(兴国红鲤、荷包红鲤、玻璃红鲤和建鲤)和2个长江干流天然群体(湖北监利和江苏扬州)的10个微卫星标记结果进行分析,以有效检测人工选育群体间以及选育群体与天然群体间的遗传差异。主成分分析显示,人工选育群体与天然群体存在一定程度的遗传分化,荷包红鲤与天然群体的遗传差异最大,其主成分1(PC1)和主成分2(PC2)解释了总遗传变异的48.23%;在贝叶斯遗传聚类分析中,6个群体的最佳聚类数值为4,即兴国红鲤与2个天然群体聚为一类,玻璃红鲤、荷包红鲤和建鲤3个群体分别单独聚为一类;贝叶斯遗传重排分析显示,6个群体的遗传自排率较高,为81%～100%,玻璃红鲤和荷包红鲤的遗传自排率最高,均为100%。研究结果综合表明:4个人工选育群体与天然群体间存在较明显的遗传差异,而且天然群体已受到人工选育群体的遗传影响;这3种方法能很好地检测鲤人工选育群体间、以及选育群体与天然群体间的遗传差异。