基于二代测序的定制化基因panel检测骨髓增殖性肿瘤突变谱

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作   者：

黄秀;  黄秀;  邓萱;  邓萱;  许笑;  许笑;  张心菊;  张心菊;  张悦晟;  张悦晟;  马玮哲;  马玮哲;  胡婷婷;  胡婷婷;  唐古生;  唐古生;  关明;  关明; 

作者机构：

复旦大学附属华山医院检验科;  海军医科大学附属长海医院血液科;  复旦大学附属华山医院; 

关键词：

高通量核苷酸序列分析;  突变;  骨髓增殖性疾病; 

期刊名称：

中华检验医学杂志

基金项目：

基于LAMP纸芯片即时检测骨髓增殖性肿瘤分子标志物谱的研究
基于LAMP纸芯片即时检测骨髓增殖性肿瘤分子标志物谱的研究

i s s n：

1009-9158

年卷期：

2019 年 42 卷 006 期

页   码：

427-434

摘   要：

目的 利用由50个靶基因所组成的测序panel,分析骨髓增殖性肿瘤(MPN)三种主要亚型原发性血小板增多症(ET),真性红细胞增多症(PV),以及原发性骨髓纤维化(PMF)的突变谱,以便为该病的诊断和预后提供有价值的信息.方法 回顾性研究方式,收集2010年至2017年间来自华山医院以及长海医院血液科的MPN患者标本共53例.所有患者的诊断均符合2016年WHO的诊断标准,包括ET31例(男11例,女20例,中位数年龄55岁),PV17例(男12例,女5例,中位数年龄65岁),PMF5例(男4例,女1例,中位数年龄67岁),并进行其骨髓或者血液标本DNA的二代测序.根据COSMIC,dbSNP,Clinvar等公共数据库对测序结果进行分析,绘制MPN人群的突变谱,并结合患者的临床随访资料进行解读.结果 除去典型的JAK2、CALR、MPL突变,还检测出了另外11种基因的致病性突变,以及4种与赋予个体MPN疾病易感性相关的寡核苷酸多态性(SNP)位点(rs4858647,rs9376092,rs58270997,rs621940).平均每个患者的突变基因数目为2.3个.全部患者(53例)中,基因突变频率由高到低依次为TET2(40%),EZH2(26%),ASXL1(11%),MIR662(6%),SF3B1(6%),BARD1(6%),DNMT3A(4%),KIT(2%),RUNX1(2%),TP53(2%),NRAS(2%).结论 利用靶向基因二代测序技术,能实现一次性对多例典型的BCR-ABL阴性的MPN患者进行多基因外显子测序,检测周期可缩短至两天,可以发现除了JAK2、CALR、MPL突变之外其他的致病性突变,在临床有较好的应用前景.