屎肠球菌噬菌体vB_EfaS_29生物学特性及基因组分析

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作   者：

仲召鑫;  朱树娇;  张辉;  周艳;  王冉;  包红朵; 

作者机构：

江苏省食品质量安全重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所农业农村部农产品质量安全风险评估实验室(南京); 

关键词：

生物学特性;  噬菌体;  基因组分析;  屎肠球菌; 

期刊名称：

微生物学通报

基金项目：

肠出血性大肠杆菌O157噬菌体尾突蛋白对宿主受体的靶向识别机制及其动态抑菌效应研究

i s s n：

0253-2654

年卷期：

2021 年 009 期

页   码：

3154-3164

摘   要：

【背景】随着屎肠球菌耐药性越来越严重,亟需筛选获得新的、裂解效率高且遗传背景清晰的裂解性噬菌体,丰富噬菌体资源,为噬菌体疗法提供可用的菌株。【目的】从江苏省南京市西岗奶牛场粪便样品中分离出一株裂解性屎肠球菌噬菌体,研究其生物学特性及分析基因组学特征。【方法】通过双层平板法对其进行纯化,观察噬菌斑特征,透射电镜观察噬菌体形态,测定一步生长曲线、pH耐受性、温度耐受性以及最佳感染复数,对噬菌体进行全基因组测序及遗传进化分析。【结果】分离并纯化的一株裂解性屎肠球菌噬菌体命名为vBEfaS29,其噬菌斑圆形透亮,外周无晕环。该噬菌体头部呈二十面体,头部直径约52.4 nm,尾长约157.1 nm,为长尾噬菌体科。该噬菌体的最佳感染复数为0.1,最高耐受温度为70℃左右,当pH值在6.0-9.0时其效价稳定。一步生长曲线表明,其潜伏期为10 min,暴发期约为50 min,暴发量为80。基因组全长41 014 bp,GC含量为34.99%,共有63个开放阅读框（Open Reading Frame,ORF）,其中36个被注释出已知基因,基因组中不含毒力基因、耐药基因及整合基因。进化分析显示以裂解酶编码氨基酸为靶标对比,该噬菌体与GenBank上的粪肠球菌噬菌体vBEfaSDELF1相似性大于99%,但是以噬菌体衣壳蛋白编码氨基酸为靶标比对发现,该噬菌体肠球菌与其他噬菌体遗传距离均较远。【结论】分离出一株裂解性屎肠球菌噬菌体,对其进行生物学特性及基因组分析,为噬菌体研究和应用提供理论依据及研究基础。