双样本双向孟德尔随机化法分析人免疫细胞与增生性瘢痕之间的因果关系

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作   者：

吴虹林;  陈咏菲;  李舒婷;  杨浩;  李晓卉;  唐冰;  朱家源;  胡志成; 

作者机构：

中山大学附属第一医院烧伤与创面修复科; 

关键词：

增生性瘢痕;  孟德尔随机化分析;  免疫,细胞;  因果律; 

期刊名称：

中华烧伤与创面修复杂志

i s s n：

年卷期：

2024 年 006 期

页   码：

572-578

摘   要：

目的运用双样本双向孟德尔随机化法,探讨人免疫细胞与增生性瘢痕(HS)之间的因果关系.方法该研究基于双样本双向孟德尔随机化(MR)法,分别从全基因组关联分析catalog数据库和FinnGen数据库获取731种人免疫细胞与HS的数据集.设置显著阈值,筛选与免疫细胞及HS显著相关的单核苷酸多态性(SNP)并排除弱工具变量偏倚的影响.采用逆方差加权(IVW)法[同时采用错误发现率(FDR)中的Benjamini-Hochberg法校正其P值]初步检测免疫细胞与HS的因果关系并筛选与HS有显著因果关系的免疫细胞.进一步地,采用双样本MR分析的5种方法:IVW法、加权中位数法、简单模式法、加权模式法和MR-Egger法绘制散布图检测筛选出的免疫细胞与HS的因果关系.针对符合假设的免疫细胞SNP,进行Cochran Q检验评估异质性,进行MR-Egger回归和MR-PRESSO法排除水平多效性,进行留一法分析来评估显著结果是否由单个SNP决定.采用双样本MR分析中IVW法反向检测HS与免疫细胞之间的因果关系.结果731种免疫细胞达到显著阈值的SNP数量从7个到1786个不等,HS中达到显著阈值的SNP数量有119个,这些SNP的F值均>10,提示具有弱工具变量偏倚的可能性较小.IVW法分析显示,60种免疫细胞与HS具有潜在因果关系(P值均<0.05),经Benjamini-Hochberg法校正后,仅CD45RA和CD39双阳性调节性T细胞(Treg)与HS具有潜在因果关系(P FDR<0.05).IVW法(比值比为1.16,95%置信区间为1.08~1.24,P<0.05、P FDR<0.05)、加权中位数法(比值比为1.16,95%置信区间为1.05~1.28,P<0.05)、加权模式法(比值比为1.14,95%置信区间为1.02~1.27,P<0.05)和MR-Egger法(比值比为1.18,95%置信区间为1.07~1.30,P<0.05)的散布图均显示,CD45RA和CD39双阳性Treg的14个SNP与HS患病风险存在因果关系;仅简单模式法的散布图显示,CD45RA和CD39双阳性Treg的14个SNP与HS患病风险的因果关系不明显(P>0.05).Cochran Q检验显示,CD45RA和CD39双阳性Treg与HS的因果关系不存在异质性(P>0.05).MR-Egger回归、MR-PRESSO法分析显示,CD45RA和CD39双阳性Treg与HS的显著因果关系不存在水平多效性(P>0.05).留一法分析显示,CD45RA和CD39双阳性Treg与HS的显著因果关系在逐个剔除SNP后结果稳定.双样本反向MR分析显示,HS与731种免疫细胞均无潜在因果关系(P>0.05).结论从遗传学的角度揭示,免疫细胞CD45RA和CD39双阳性Treg可能会增加HS患病风险.