珊瑚菜盐胁迫相关GlRTH基因的克隆和表达量分析

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作   者：

徐瑶;  任宏伟;  张馨方;  王芳;  朱丹;  谭玲玲;  袁涛;  高婷; 

作者机构：

青岛农业大学建筑工程学院;  青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室; 

关键词：

qRT-PCR;  表达量分析;  GlRTH基因;  生物信息学分析;  珊瑚菜; 

期刊名称：

中草药

i s s n：

0253-2670

年卷期：

2023 年 54 卷 011 期

页   码：

3639-3646

摘   要：

目的 筛选得到珊瑚菜Glehnia littoralis抗盐相关基因GlRTH,并进行开放阅读框(open reading frame,ORF)全长克隆以及生物信息学和表达量分析.方法 从珊瑚菜转录组数据中筛选到GlRTH基因,通过反转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)以及 cDNA 末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)获得该基因全长ORF序列,利用生物信息学分析方法分析其所编码蛋白质的理化性质,预测该蛋白二、三级结构、保守结构域,建立系统发育进化树;利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)方法检测该基因组织表达特异性及其在NaCl和1-氨基环丙烷羧酸(1-aminocyclopropanecarboxylic acid,ACC)处理下的表达差异.结果 GlRTH基因序列全长ORF为690 bp,共编码229个氨基酸.系统进化分析表明,珊瑚菜的RTH蛋白与黄胡萝卜Daucus carota subsp.sativus的RTH蛋白亲缘关系最近,相似度达88.65%;qRT-PCR结果显示,GlRTH基因在珊瑚菜的根、叶、花中均有表达,在花中表达量较高,叶和根中无显著差异;200 mmol/L的NaCl处理3、6、12、24、36 h,GlRTH基因表达量明显上调,且处理36 h后GlRTH基因表达量上调最为显著;100mmol/LACC处理,GlRTH基因的表达量呈先上升再下降的趋势,在3 h时GlRTH基因表达量显著上调,在6h和12h时GlRTH基因表达量下调.结论 GlRTH蛋白是乙烯响应因子,并且与珊瑚菜的耐盐性相关.为探究乙烯信号通路和药用植物抗盐反应的关系及改良珊瑚菜的耐盐能力奠定了基础.