基于eDNA技术的舟山近海中国团扇鳐定性与定量分析

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作   者：

高天翔;  张浩博;  王晓艳;  陈治; 

关键词：

微滴式数字PCR;  TaqMan;  环境DNA,eDNA;  中国团扇鳐;  细胞色素c氧化酶亚基I(COI)基因; 

期刊名称：

水产学报

i s s n：

1000-0615

年卷期：

2024 年 48 卷 003 期

页   码：

116-125

摘   要：

为探讨环境DNA(environmental DNA,eDNA)技术用于中国团扇鳐监测方面的可行性,同时开展基于eDNA技术的舟山近海中国团扇鳐定性与定量分析.本实验将中国团扇鳐与其同属汤氏团扇鳐COI基因片段序列进行比较分析,使用Primer Express 3.0 软件设计中国团扇鳐特异性引物与TaqMan探针.在舟山朱家尖近海设计了A、B、C共 3 个定置网调查站位,定期收集中国团扇鳐样品.于 2017 年 12 月 19 日、2018 年 4 月 13 日和 2018年 7 月 14 日分别采集水样(站位A、B1、B2、C1、C2、D),开展eDNA微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)检测,并将检测结果与水温和采样点进行差异显著性分析.结果显示,不同站位、不同时间的中国团扇鳐eDNA浓度不同,水样采集点对中国团扇鳐eDNA浓度的影响极显著,不同采样点eDNA在不同季节存在极显著差异.研究表明,eDNA检测技术灵敏度高,水温、底质和水深对中国团扇鳐的分布皆有影响.研究结果为其他海域的中国团扇鳐eDNA追踪监测奠定了基础.