大叶黄精和黄精中与有机酸代谢相关的bHLH转录因子家族分析

• 全文链接
• 请求原文

作   者：

朱天润;  万小林;  粱思琪;  肖强; 

作者机构：

湖北民族大学林学园艺学院/生物资源保护与利用湖北省重点实验室; 

关键词：

生物信息学;  家族;  大叶黄精(Polygonatum kingianum var. grandifolium);  鉴定;  bHLH转录因子;  黄精(Polygonatum sibiricum Red);  有机酸; 

期刊名称：

湖北农业科学

i s s n：

0439-8114

年卷期：

2025 年 64 卷 002 期

页   码：

202-206

摘   要：

采用测序平台对大叶黄精（Polygonatum kingianum var. grandifolium）和黄精（Polygonatum sibiricum Red）转录组进行测序，利用生物信息学方法对与有机酸代谢相关的bHLH转录因子家族进行鉴定，对预测的蛋白质开展理化性质、结构域以及系统进化关系的分析。结果表明，基于大叶黄精和黄精的转录组数据，共获得转录因子46 682个，其中bHLH转录因子110个；总转录数据中具有显著差异的转录因子共978个，其中bHLH转录因子共53个；结合代谢组预测数据，得到与有机酸相关的转录因子31个，其中与有机酸相关的bHLH转录因子22个。除Cluster-43865.11外，Motif 1在其他序列中均有分布，绝大多数序列均含Motif 4;22个bHLH转录因子家族成员均存在不同程度的保守基序变异现象，每个bHLH含有1～14个Motif，平均含有7.81个Motif。