基于生物信息学方法筛选和验证肝癌预后标志物

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作   者：

米宁宁;  白明圳;  高龙;  马海东;  付文康;  林延延;  孟文勃; 

作者机构：

兰州大学第一临床医学院;  兰州大学第一医院; 

关键词：

生物信息学;  核心基因;  肝细胞癌（HCC）;  预后;  免疫细胞; 

期刊名称：

生命科学研究

i s s n：

年卷期：

2022 年 006 期

页   码：

538-548

摘   要：

运用生物信息学方法探究肝细胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）发生发展的核心基因及预后标志物。下载GEO （Gene Expression Omnibus）数据库中的GSE112790芯片数据及癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas, TCGA）数据库中的肝癌数据,分析得到151个差异表达基因（differentially expressed gene, DEG）并筛选出10个核心基因。生存分析表明, BUB1B、CDC20、ASPM和DLGAP5基因高表达显著影响患者预后。Oncomine数据库分析结果证实, BUB1B、CDC20和DLGAP5的表达水平与肿瘤分级和血管浸润明显相关。HPA数据库及肝癌组织芯片的免疫组织化学实验结果均显示,相对于正常肝组织,肝癌组织中CDC20和DLGAP5蛋白高表达。Cox分析结果提示, CDC20和DLGAP5可作为肝癌患者预后的独立危险因素。此外, CDC20甲基化水平是影响其表达水平的重要因素,并且和多种免疫细胞的表达相关。上述研究结果表明, CDC20可作为肝癌患者预后评估的潜在生物标志物或治疗靶点。