3-O-C12-HSL作用下Mo-DCs的circRNA表达谱与功能富集分析

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作   者：

陈敏怡;  陈蕾妃;  李有强;  张云燕; 

作者机构：

南方医科大学附属何贤纪念医院检验科;  广州医科大学口腔医学院; 

关键词：

N-3-氧化十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯;  树突状细胞;  circRNA芯片测序;  环状RNA;  生物信息学分析; 

期刊名称：

热带医学杂志

i s s n：

1672-3619

年卷期：

2024 年 24 卷 010 期

页   码：

1361-1366,1378,封2

摘   要：

目的 探讨单核细胞来源树突状细胞(Mo-DCs)在N-3-氧化十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯(3-O-C12-HSL)作用下其环状RNA(circRNA)表达谱的影响及功能富集.方法 取健康志愿者新鲜外周血,经Fi-coll密度梯度离心及免疫磁珠分选获得CD14+单核细胞,重组人白细胞介素-4(hIL-4)、重组人粒-巨噬细胞集落刺激因子(hGM-CSF)细胞因子诱导分化为Mo-DCs,将细胞用0.1 μg/mL脂多糖(LPS)(LPS组、阳性对照)、0.1%二甲基亚砜(DMSO)(DMSO 组、阴性对照)或 25 μmol/L 3-O-C12-HSL 和 0.1 μg/mL LPS(3-O-C12-HSL 组)分别处理.采用 Arraystar CircRNA芯片筛选三组差异表达的circRNA,并对差异表达circRNA靶基因作功能富集分析.结果 circRNA微阵列分析检测到12 967个circRNA在Mo-DCs中表达,根据P<0.05和FC≥1.2的标准进行筛选,与LPS组相比,3-O-C12-HSL组有122个circRNA显著上调,77个显著下调;与DMSO组相比,3-O-C12-HSL组有64个circRNA显著上调,122个显著下调.GO和KEGG富集分析表明,差异表达的circRNA亲本基因主要富集于转化生长因子-β、趋化因子、ErbB等信号通路上,主要参与树突状细胞分化、Fcγ受体介导的吞噬作用及淋巴细胞分化调节等过程.通过ENCORI数据库预测大量miRNA与circRNA存在结合位点,并构建了ceRNA网络图.结论 3-O-C12-HSL影响了 Mo-DCs成熟过程中circRNA的表达.