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一株枯草芽孢杆菌噬菌体Bac-S的生物学特性及全基因组序列分析

作   者:
赵欣卓王鑫淼王丽艳吴楠李喜梅于镇华荆瑞勇刘俊杰
作者机构:
中国科学院东北地理与农业生态研究所黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院
关键词:
枯草芽孢杆菌生物学特性噬菌体基因组
期刊名称:
微生物学报
i s s n:
0001-6209
年卷期:
2024 年 64 卷 009 期
页   码:
3379-3392
摘   要:
【目的】枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)施用于土壤可促进植物生长,但针对土壤中枯草芽孢杆菌噬菌体的研究鲜有报道,因此从土壤中分离出枯草芽孢杆菌噬菌体,并深入研究其生物学特性及基因组特征,不仅有助于枯草芽孢杆菌的实际应用,还能丰富枯草芽孢杆菌噬菌体相关生物信息库。【方法】以枯草芽孢杆菌SM13为宿主,从土壤中分离培养出一株噬菌体Bac-S,对其进行生物学特性测定、全基因组序列特征、基因功能注释和系统发育分析。【结果】透射电镜显示,噬菌体Bac-S头部直径约为43 nm,尾部极短无法测量;该噬菌体的最佳感染复数(multiplicity of infection,MOI)为0.1;一步生长曲线显示,潜伏期约为10 min,裂解量为30 PFU/cell;宿主谱广泛,能实现跨属侵染;测序结果显示其基因组长度为150 019 bp,G+C含量为42.6%;该噬菌体共有237个开放阅读框(open reading frames,ORFs),BLASTn比对显示该噬菌体与NCBI数据库中其他芽孢杆菌噬菌体相似性较高。【结论】从土壤中分离出了一株具有潜伏期短、宿主谱广泛、耐受高温、不耐紫外光照射的特征枯草芽孢杆菌噬菌体,拓宽了对枯草芽孢杆菌噬菌体的认知。
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