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一株枯草芽孢杆菌噬菌体Bac-S的生物学特性及全基因组序列分析
- 作 者:
-
赵欣卓;
王鑫淼;
王丽艳;
吴楠;
李喜梅;
于镇华;
荆瑞勇;
刘俊杰;
- 作者机构:
-
中国科学院东北地理与农业生态研究所;
黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院;
- 关键词:
-
枯草芽孢杆菌;
生物学特性;
噬菌体;
基因组;
- 期刊名称:
- 微生物学报
- i s s n:
- 0001-6209
- 年卷期:
-
2024 年
64 卷
009 期
- 页 码:
- 3379-3392
- 摘 要:
-
【目的】枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)施用于土壤可促进植物生长,但针对土壤中枯草芽孢杆菌噬菌体的研究鲜有报道,因此从土壤中分离出枯草芽孢杆菌噬菌体,并深入研究其生物学特性及基因组特征,不仅有助于枯草芽孢杆菌的实际应用,还能丰富枯草芽孢杆菌噬菌体相关生物信息库。【方法】以枯草芽孢杆菌SM13为宿主,从土壤中分离培养出一株噬菌体Bac-S,对其进行生物学特性测定、全基因组序列特征、基因功能注释和系统发育分析。【结果】透射电镜显示,噬菌体Bac-S头部直径约为43 nm,尾部极短无法测量;该噬菌体的最佳感染复数(multiplicity of infection,MOI)为0.1;一步生长曲线显示,潜伏期约为10 min,裂解量为30 PFU/cell;宿主谱广泛,能实现跨属侵染;测序结果显示其基因组长度为150 019 bp,G+C含量为42.6%;该噬菌体共有237个开放阅读框(open reading frames,ORFs),BLASTn比对显示该噬菌体与NCBI数据库中其他芽孢杆菌噬菌体相似性较高。【结论】从土壤中分离出了一株具有潜伏期短、宿主谱广泛、耐受高温、不耐紫外光照射的特征枯草芽孢杆菌噬菌体,拓宽了对枯草芽孢杆菌噬菌体的认知。
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