苗药八爪金龙转录组测序与次生代谢产物合成相关基因的挖掘

• 全文链接
• 请求原文

作   者：

刘畅;  俸婷婷;  刘雄伟;  丁晶鑫;  石慧;  潘婕;  周英; 

作者机构：

贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心; 

关键词：

八爪金龙;  生物合成;  次生代谢;  基因;  转录组; 

期刊名称：

中草药

基金项目：

苗药大品种开喉剑喷雾剂、金骨莲胶囊的关键技术提升与应用示范

i s s n：

0253-2670

年卷期：

2021 年 005 期

页   码：

1434-1447

摘   要：

目的对八爪金龙根进行转录组测序,挖掘次生代谢合成相关基因,探索八爪金龙次生代谢产物生物合成的分子基础。方法采用IlluminaHi Seq4000高通量测序技术,对八爪金龙根进行转录组测序。使用Trinity软件对获得的Unigenes数据进行过滤组装,运用KEGG数据库对Unigenes进行注释。结果共获得52249条Unigenes,其中31391条被公共数据库成功注释,1507条Unigenes被注释到次生代谢产物合成。通过对转录组数据深入挖掘发现,参与八爪金龙苯丙素生物合成的Unigenes共有126条,参与萜类化合物骨架生物合成的Unigenes数量为73条,参与黄酮类化合物生物合成Unigenes有58条,参与次生代谢后修饰的Unigenes共有253条。筛选出9条Unigenes编码4个与八爪金龙香豆素生物合成的关键酶,23条Unigenes编码8个与黄酮生物合成的关键酶,39条Unigenes编码19个与萜类生物合成的关键酶,140条CYP450基因和113条UGT基因可能参与次生代谢物的修饰。微卫星识别软件（microsatellite identification tool,MISA）分析发现八爪金龙转录组包含17 400个简单重复序列（simple sequence repeats,SSR）。结论通过高通量转录组测序,初步揭示了参与八爪金龙次生代谢产物合成相关的基因,为进一步研究八爪金龙次生代谢产物合成途径关键酶的功能及其调控机制奠定了基础。