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水环境下羧基与氨基间为单氢键的α-Ala旋光异构及羟自由基和氢氧根的作用

作   者:
闫红彦王佐成佟华杨晓翠
作者机构:
白城师范学院计算机科学学院白城师范学院物理学院
关键词:
α-丙氨酸旋光异构密度泛函理论氢氧根微扰理论自洽反应场羟自由基过渡态
期刊名称:
浙江大学学报(理学版)
基金项目:
i s s n:
1008-9497
年卷期:
2019 年 01 期
页   码:
48-57
摘   要:
采用密度泛函理论的B3LYP方法、微扰理论的MP2方法和自洽反应场(SCRF)理论的SMD模型方法,研究了水环境下羧基与氨基间为单氢键的α-Ala旋光异构及羟自由基和氢氧根作用的反应。研究发现:α-Ala的旋光异构可在a和b两个通道实现,a通道为羧基顺反异构后,水分子簇作媒介质子以氨基为桥从α碳的一侧向另一侧迁移;b通道为水分子簇作媒介,质子从α碳向氨基氮的迁移与羧基顺反异构协同进行。在a通道,羟自由基水分子簇可致α-Ala损伤。势能面计算表明:水环境下,在a通道3个水分子簇作氢迁移媒介,决速步能垒为113.37 kJ·mol~(-1),氢氧根水分子簇的催化使该能垒降到64.45 kJ·mol~(-1);在b通道2个水分子簇作氢迁移媒介,决速步能垒为135.00 kJ·mol~(-1)。羟自由基水分子簇致α-Ala损伤的能垒在水分子抽氢和羟自由基抽氢时分别为24.47和80.60 kJ·mol~(-1)。
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