黄麻羽肉鸡β-防御素基因AvBD1和AvBD2克隆、生物信息学分析及组织表达

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作   者：

康丹菊;  彭秋云;  周嘉欣;  陈进军;  林红英;  周光现; 

作者机构：

广东海洋大学滨海农业学院; 

关键词：

克隆;  组织表达;  序列分析;  黄麻羽肉鸡;  AvBD2基因;  AvBD1基因; 

期刊名称：

中国畜牧兽医

i s s n：

年卷期：

2023 年 011 期

页   码：

4325-4337

摘   要：

【目的】防御素是生物体内产生的具有广谱抗微生物作用的活性肽。深入认识鸡β-防御素AvBD1和AvBD2的基本信息，有助于进一步研究和应用其生物学功能。【方法】采用PCR方法扩增黄麻羽肉鸡AvBD1和AvBD2基因并克隆测序，将测序获得的CDS序列推导成氨基酸序列后进行相似性比对，利用在线软件分析所预测蛋白的生物信息学特性，并探究二者在黄麻羽肉鸡不同组织中的表达情况。【结果】黄麻羽肉鸡AvBD1和AvBD2基因CDS区大小分别为198和195 bp,可编码65和64个氨基酸，二者CDS区序列相似度为56%,氨基酸序列相似度为36%,可见二者并非同源基因。系统进化树表明，黄麻羽肉鸡与其他几个品种鸡的亲缘关系较近，其中AvBD1基因与小鼠亲缘关系最远；AvBD2基因与大山雀亲缘关系最远。生物信息学分析结果显示，AvBD1和AvBD2均为疏水性蛋白，且AvBD1疏水性和稳定性均强于AvBD2,均存在信号肽，但所处氨基酸位点不同，无跨膜结构域，二级结构主要元件分别为α-螺旋和无规则卷曲，但参与形成这2种构象的氨基酸比例差异较大。实时荧光定量PCR分析发现，AvBD1和AvBD2基因在黄麻羽肉鸡心脏、肝脏、肺脏、肾脏和十二指肠组织中整体表达趋势相似，均以肺脏中表达量最高，十二指肠中表达量最低。【结论】试验成功克隆了黄麻羽肉鸡AvBD1和AvBD2基因CDS区全长序列，分析了AvBD1和AvBD2蛋白的结构和功能，二者在黄麻羽肉鸡内脏组织中的mRNA表达趋势一致，为进一步阐明AvBD1和AvBD2的生物学功能及其在生产中的应用提供参考依据。