胡杨AHL基因家族生物信息学分析及逆境胁迫下的表达特征

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作   者：

刘行行;  种培芳; 

作者机构：

甘肃农业大学林学院; 

关键词：

生物信息学;  AHL基因家族;  胡杨;  qRT-PCR; 

期刊名称：

草地学报

i s s n：

年卷期：

2023 年 003 期

页   码：

741-750

摘   要：

AT-hook核定位（AT-hook motif nuclear localized, AHL）蛋白作为一种小型DNA结合蛋白，广泛存在于植物中，在植物生长发育、逆境胁迫和激素信号应答等方面发挥着重要的作用。为全面了解胡杨（Populus euphratica）AHL基因家族的结构及功能，利用生物信息学方法及qRT-PCR对胡杨AHL家族成员的理化性质、基因结构、亚细胞定位以及逆境胁迫下的表达特征进行分析。理化性质分析表明，胡杨AHL家族共有19个成员，除PeAHL16外，其余PeAHL蛋白均为碱性的不稳定亲水蛋白。基因结构分析表明，PeAHL成员全部为内含子缺失型基因。系统进化结果显示，胡杨AHL家族成员可根据基因类型分为8个亚群。保守基序分析显示，聚类在同一分支中的PeAHL基因其motif组成及排列顺序基本相同。在顺式作用元件分析中，响应干旱胁迫的元件其种类和数量最多。实时荧光定量分析表明，PeAHLs的表达受低温、高温、NaCl以及PEG的显著诱导，与对照相比，PeAHLs在PEG处理下表达量最高。本研究结果为胡杨AHL基因家族的深入研究提供理论依据，为进一步解析胡杨AHL基因参与非生物逆境胁迫的分子机制提供参考。