水稻5S rDNA和着丝粒顺序RCS2拷贝数的Fiber-FISH测定

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作   者：

李宗芸;  黄思罗;  金危危;  宁顺斌;  宋运淳;  李立家; 

作者机构：

武汉大学植物发育生物学教育部重点实验室; 

关键词：

rDNA;  着丝粒DNA顺序;  水稻;  5S;  拷贝数;  DNA纤维荧光原位杂交(DNA;  Fiber-FISH); 

期刊名称：

科学通报

i s s n：

0023-074X

年卷期：

2001 年 46 卷 19 期

页   码：

1641-1644+1677

摘   要：

用伸展DNA纤维的荧光原位杂交(Fiber-FISH)技术测定了5S rDNA和着丝粒DNA顺序RCS2在水稻广陆矮四号(Oryza sativa ssp indica cv Guangluai No4)基因组中的拷贝数. 为了确定拷贝数, 需要知道显微镜下一定长度DNA纤维所含碱基对数. 为此, 测量了两个已知碱基对数DNA序列的伸展纤维在显微镜下的长度. 其中供试BAC38D17的插入序列为136 kb, 其伸展纤维在显微镜下的长度为56.4 μm, 平均为2.41 kb/μm; BAC44B4全长为144.5 kb, 其伸展纤维的长度为55.7 μm, 平均为2.60 kb/μm. 这与Watson-Crick模型中B-DNA的2.97 kb/μm十分接近. 根据两个样本每微米平均碱基数, 即2.51 kb/μm的标准, 计算出5S rDNA的拷贝数约为686, 着丝粒DNA顺序RCS2约为286～1121拷贝.