黄梁木海藻糖-6-磷酸合酶TPS基因家族鉴定与表达分析

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作   者：

张丽素;  高佳钰;  龙健梅;  彭昌操; 

作者机构：

华南农业大学林学与风景园林学院; 

关键词：

黄梁木(Neolamarckia cadamba);  海藻糖-6-磷酸合酶;  生物信息学分析;  表达模式; 

期刊名称：

分子植物育种

i s s n：

1672-416X

年卷期：

2025 年 23 卷 002 期

页   码：

353-361

摘   要：

植物海藻糖-6-磷酸合酶(trehalose-6-phosphate synthase, TPS)在植物生长发育和逆境响应中具有重要意义。为了研究南方速生树种黄梁木中TPS的生物学功能，本研究从黄梁木基因组数据库中筛选到12个TPS基因，分析了其家族进化关系以及序列特征，并检测基因的表达模式。结果显示NcTPS基因随机分布于8条染色体和1个scaffold上，分为Ⅰ类和Ⅱ类TPS;NcTPS基因长度为2 352～25 100 bp，其中Ⅰ类TPS有14～18个外显子，Ⅱ类TPS有2～5个外显子。除NcTPS7c外，其他蛋白均有TPS和TPP (trehalose-6-phosphate phosphatase,海藻糖-6-磷酸磷酸酶)结构域。NcTPS编码区长度在1 626～2 847 bp之间，蛋白序列长度为541～948 aa。NcTPS蛋白除NcTPS7c显碱性外其余皆显酸性，均为亲水性蛋白。分析NcTPS的表达模式，发现NcTPS基因在黄梁木中的表达具有时空特异性，其中NcTPS11a、NcTPS11b、NcTPS7a和NcTPS7b在根中表达量较高，推测其对黄梁木根的生长发育具有重要意义。本研究为后续深入研究黄梁木TPS基因对其生长发育以及逆境响应的作用提供参考。