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黄精转录组特性分析及相关功能基因研究
- 作 者:
-
王宇;
谭福燕;
张利萍;
何玉丰;
范建辉;
李旺;
彭柿杰;
邱庆华;
- 作者机构:
-
攀枝花学院医学院;
攀枝花学院康养学院;
攀枝花学院附属医院;
- 关键词:
-
多糖;
黄精;
黄酮;
皂苷;
转录组;
- 期刊名称:
- 四川师范大学学报(自然科学版)
- i s s n:
- 1001-8395
- 年卷期:
-
2022 年
01 期
- 页 码:
- 103-109
- 摘 要:
-
分析黄精转录组数据,挖掘与黄精中多糖、皂苷元、黄酮生物合成途径相关的关键酶基因.利用Illumina HiSeq测序平台对黄精全株进行转录组测序,对测序结果进行注释分析.共获得146 072个有效转录本,超过51.00%的转录本在NR、Swiss-Prot、KOG、GO、KEGG数据库中获得注释.β-呋喃果糖苷酶、己糖激酶等参与了黄精多糖的生物合成;UDP-葡萄糖基转移酶、β-葡萄糖苷酶等参与黄精皂苷元的生物合成途径;查尔酮异构酶、查尔酮合成酶等参与黄精内黄酮的生物合成途径.初步获得黄精中参与黄精多糖、皂苷元、黄酮生物合成的候选关键酶基因,为进一步研究黄精的生理生化代谢奠定了基础.
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