运用实时定量PCR和16SrDNA测序法分析女性阴道菌群的结果比较

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作   者：

张宁;  韩阳;  骆菲;  朱丽红;  秦金红;  江滟; 

作者机构：

上海交通大学基础医学院免疫学与微生物学系;  上海交通大学医学院附属国际和平妇幼保健院;  贵州医科大学贵州省普通高校病原生物学特色重点实验室;  复旦大学附属华东医院妇科; 

关键词：

阴道菌群;  实时定量PCR;  16S rDNA高通量测序; 

期刊名称：

上海交通大学学报(医学版)

基金项目：

i s s n：

1674-8115

年卷期：

2018 年 01 期

页   码：

71-75

摘   要：

目的·比较实时定量PCR(q PCR)法与16S rDNA测序法分析女性阴道菌群类型的结果。方法·选取45岁以下育龄期健康女性49名,采集阴道上1/3处分泌物,经提取阴道标本全基因组DNA后,分别运用16S rDNA V1V2域测序和基于22种常见阴道细菌设计的引物进行q PCR分析各样本菌群类型,比较2种检测结果的异同。结果·参考依据优势菌类型的阴道菌群分类标准,基于q PCR方法分析结果为Ⅰ型(卷曲乳杆菌为优势菌)9例,Ⅲ型(惰性乳杆菌为优势菌)24例,Ⅳ型(无乳杆菌为优势菌)12例,Ⅴ型(詹氏乳杆菌为优势菌)为2例。基于16S rDNA V1V2域进行测序分析的结果为Ⅰ型13例,Ⅱ型(格氏乳杆菌为优势菌)1例,Ⅲ型23例,Ⅳ型8例,Ⅴ型2例。2种方法对阴道菌群分型一致的为38例,一致率为77.6%。结论·2种方法分析得到的阴道菌群分类结果有差异;若采用q PCR对阴道菌群进行分类,还需考虑相关的技术因素对结果的影响。