不同来源金黄色葡萄球菌的全基因组序列分析

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作   者：

陈驰;  石继春;  王春娥;  梁丽;  龙新星;  叶强;  徐颖华; 

作者机构：

中国食品药品检定研究院卫健委生物技术产品检定方法及其标准化重点实验室; 

关键词：

全基因组测序;  金黄色葡萄球菌;  不同来源;  耐药基因;  毒力因子; 

期刊名称：

中国病原生物学杂志

i s s n：

1673-5234

年卷期：

2022 年 002 期

页   码：

165-169

摘   要：

目的 了解不同来源金黄色葡萄球菌（简称金葡菌）的全基因组序列基本特征，探究菌株的分子分型、耐药基因型、毒力及其遗传进化关系。方法 应用solexa高通量测序技术对10株医源性和食源性代表株金葡菌进行全基因组测序，以此进行多位点序列分型（multilocus sequence typing, MLST）、金葡菌a蛋白（Staphylococcus aureus protein A,spa）基因分型分析，并比较分析不同菌株基因组中携带耐药基因和毒力因子，筛选核心基因，构建系统进化树。结果 10株金葡菌染色体基因组大小相似，均为2.7 Mbp,包含有2 486～2 648个基因不等，平均长度约为887 bp。耐药基因注释分析显示9株甲氧西林敏感金葡菌（MSSA）携带的耐药基因少于另一株耐甲氧西林金葡菌（MRSA）。尽管在不同菌株基因组之间的毒力因子数量无显著区别，但不同菌株存在的毒力因子却不同，食品来源金葡菌基因组携带1～4种数量不等的肠毒素基因。进化树分析显示不同来源金葡菌位于不同进化分支，2株为ST8型的MSSA和MRSA进化亲缘性较高，属于同一进化分支内。结论 获得10株不同来源金葡菌的全基因组序列数据，并证实食源性或医院来源金葡菌为了适应不同生存环境，通过不同分子进化机制，获得不同耐药基因和毒力因子，形成菌株特定的分子遗传特征，可为金葡菌的分子流行病学和致病性机制研究提供参考依据。