基于转录组学的刺五加不同药用部位的差异表达基因分析

• 全文链接
• 请求原文

作   者：

陈昊媛;  丁悦;  唐晓雷;  毛英民;  苏航;  齐滨; 

作者机构：

长春中医药大学附属医院;  长春中医药大学药学院;  长春中医药大学人参研究科学院; 

关键词：

差异表达基因;  功能注释;  刺五加;  转录组; 

期刊名称：

分子植物育种

i s s n：

1672-416X

年卷期：

2025 年 23 卷 006 期

页   码：

2007-2013

摘   要：

本研究基于刺五加的不同药用部位根与叶转录组测序，分析差异表达基因，采集刺五加根和叶两部分，提取RNA并构建c DNA文库，利用Illumina Hiseq高通量测序平台进行测序。根据FDR≤0.01和FC≥2的标准筛选DEG，对差异表达基因进行功能注释，基于注释信息，分析关键酶在刺五加根与叶中的表达差异。研究结果共得到37.87 Gb Clean Data,Q30碱基百分比在92.61%及以上，组装后共获得56 966条unigene。与各数据库比对后，共获得31 116条unigene的注释结果，按照标准筛选后得到13 607个DEGs，显著上调的基因有6 404个，显著下调的基因有7 203个，且具有显著性差异。进行GO注释与KEGG富集，分别有6 723个差异基因获得GO注释，6 424个差异基因富集到124个KEGG代谢通路。本研究分析了刺五加不同组织的基因表达差异，为其有效成分合成途径及其应用提供参考依据。