基于泛癌Bulk RNA-Seq探索不同五运六气气化体质人群肿瘤的生物学特征

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作   者：

唐心浩;  储博文;  李辰天一;  王映菲;  夏仲卉;  李梓墨;  田心语;  王聪颖;  陈琪;  郝帅;  陶维;  王建明;  吴勉华;  郑晓红; 

作者机构：

皖南医学院微生物与免疫教研室;  南京中医药大学中医学院;  南京中医药大学太仓附属医院;  江汉大学医学部药学系;  南京大学医学院附属金陵医院;  南京中医药大学中医药文献研究所;  国家癌症中心分子肿瘤学国家重点实验室;  江苏省老龄事业发展研究会老年康养与中医药研究专委会;  南京中医药大学第一临床医学院;  南京中医药大学附属南京中医院; 

关键词：

中西医结合;  药物虚拟筛选;  泛癌;  肿瘤分子分型;  五运六气; 

期刊名称：

中国中药杂志

i s s n：

1001-5302

年卷期：

2024 年 11 期

页   码：

3095-3112

摘   要：

中医五运六气气化理论认为先天气化体质是决定后天疾病发病特征的关键因素。既往研究表明,五运六气气化体质(以下简称体质)特征与多种肿瘤的发生发展密切相关,基于中医五运六气气化理论的肿瘤分型可反映肿瘤人群的预后风险。五运六气气化理论具有较高的应用于指导肿瘤精准医疗策略构建的潜力,然而目前尚未有学者对五运六气气化理论指导肿瘤分子分型与精准医疗策略构建进行研究。为揭示不同体质肿瘤人群的生物学特征差异,筛选适用于各体质人群的潜在抗肿瘤药物,助力构建源自中医原创思维的肿瘤中西医协同精准医疗策略。该研究从UCSC Xena获得了泛癌Bulk RNASeq数据,从英国生物库获得了GWAS队列数据,从eQ TLGen和GTEx V8获得了cis-eQTLs数据。研究基于泛癌Bulk RNASeq,利用机器学习法筛选各体质人群的特征表达基因,利用生物信息学手段探索各体质人群的生物学特征差异,利用孟德尔随机化进行药物靶点筛选,通过分子对接筛选适用于各体质人群的潜在抗肿瘤中药单体,并预测中药单体成药性。结果显示,泛癌队列中不同体质人群在无进展间隔期、生物学功能、免疫细胞丰度、肿瘤药物敏感性、免疫疗法响应程度等方面存在显著差异,提示五运六气气化理论可应用于指导肿瘤分子分型与肿瘤精准医疗策略制定。泛癌队列中不同体质人群的生物学功能特征,一定程度上诠释了五运六气气化理论等中医理论的生物学内涵,并为中医肿瘤临床治疗提供新思路。DMKN等5个特征基因被作为虚拟药物筛选受体,通过分子对接与类药性预测后筛选得到17-beta-estradiol、serotonine、trans-resveratrol、leinoleic acid等潜在抗肿瘤药物。以转录组测序为代表的组学技术将是揭示中医理论科学内涵的有力工具。在各类肿瘤人群中阐释不同体质的多组学特征,是五运六气气化理论应用于肿瘤分子分型与肿瘤精准医疗策略制定的基础。