嫁接番茄长链非编码RNA(lncRNA)的鉴定

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作   者：

杜康华;  王光;  赵重燕;  张宏;  李作森;  杨正安;  张杰; 

作者机构：

云南农业大学园林园艺学院;  云南省楚雄彝族自治州元谋今田园农业开发有限公司; 

关键词：

番茄;  长链非编码RNA;  马铃薯;  嫁接; 

期刊名称：

分子植物育种

基金项目：

蔷薇分支初生四倍体及其近缘二倍体比较DNA甲基化组学研究
番茄AMS基因的功能验证及其调控花药发育的分子机制解析

i s s n：

1672-416X

年卷期：

2021 年 004 期

页   码：

1072-1083

摘   要：

嫁接是重要的农业栽培措施之一,具有增加产量、提高抗性、改善品质等作用。目前对植物嫁接的分子机理研究已经拓展到RNA水平,但主要集中在mRNA和小RNA上,而对长链非编码RNA （lncRNA）的研究还不多见。本研究对公共数据库中嫁接番茄转录组数据进行分析,分别在接穗（番茄）和砧木（马铃薯）中鉴定出3 360和5 657个物种特异lncRNA,其中有298和847个lncRNA差异表达,9个lncRNA可在接穗和砧木间移动。进一步分析表明,lncRNA的移动机制与相对表达丰度没有明显关联,lncRNA具有调控嫁接植株代谢过程和花期的潜在作用。本研究结果为嫁接番茄lncRNA的鉴定和功能预测提供理论依据。