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HIV-1 CRF08_BC亚型感染者治疗前耐药和多态性位点分析

作   者:
张佳欣胡婧宋畅董敖渤李苗苗冯毅阮玉华邢辉廖玲洁
作者机构:
中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心
关键词:
CRF08_BC抗病毒治疗前耐药位点多态性位点
期刊名称:
中华微生物学和免疫学杂志
i s s n:
0254-5101
年卷期:
2023 年 43 卷 001 期
页   码:
20-26
摘   要:
目的:了解我国HIV-1 CRF08_BC感染者治疗前耐药情况与基因多态性特征。方法:采用横断面调查方法,收集2018年全国治疗前耐药调查中的HIV感染者血浆样本,提取RNA,扩增蛋白酶和逆转录酶(PR/RT)区基因片段并测序,利用HIVdb软件进行耐药判定,使用χ 2检验分析治疗前耐药与非耐药感染者氨基酸位点突变的差异,利用CorMut R包分析耐药位点与多态性位点间突变共变异情况,运用HIV-TRACE软件构建分子传播网络。 结果:共获得来自25个省市的465个CRF08_BC感染者的HIV序列,总耐药率为17.8%(83/465),非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)、核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)、蛋白酶类抑制剂(PIs)耐药率分别为16.6%(77/465)、1.1%(5/465)、0.9%(4/465),其中利匹韦林(RPV)的耐药率最高(15.7%,73/465)。位点E138A耐药突变的频率最高(11.6%,54/465),有6个多态性位点(S162C、K102Q、T200A、V179E、I202V、T200M)与E138A具有协同突变关系。分子传播网络显示,含有E138耐药突变位点的感染者在云南和四川地区聚集成簇,其中云南临沧聚集程度最高。结论:我国CRF08_BC感染者针对二代NNRTIs药物RPV的耐药比例较高,E138A耐药突变与多态性位点的协同突变是否会对HIV耐药程度和复制适应性产生影响,还需进一步验证。
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