铝胁迫下八仙花ABC转运蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析

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作   者：

陈海霞;  王暄;  许璐; 

作者机构：

湖南农业大学园艺学院湖南省中亚热带优质花木繁育与利用工程技术研究中心; 

关键词：

生物信息学;  ABC转运蛋白基因;  八仙花;  耐铝性; 

期刊名称：

分子植物育种

基金项目：

铝诱导八仙花柠檬酸分泌转运蛋白基因的克隆和功能分析

i s s n：

1672-416X

年卷期：

2021 年 020 期

页   码：

6613-6623

摘   要：

ABC转运蛋白是一类广泛存在于原核和真核生物中的跨膜运输蛋白,参与植物信号转导、次生代谢物运输和非生物胁迫响应等过程。本研究基于八仙花转录组数据,利用生物信息学分析方法对铝胁迫下ABC转运蛋白基因家族成员、理化性质、基因结构、系统发育以及基因表达模式进行分析。结果表明八仙花ABC转运蛋白基因家族包括48个成员,分别属于7个亚家族,其中C亚家族成员最多;亚细胞定位结果显示50%的家族成员位于质膜上;理化性质和结构域分析显示绝大多数为疏水性蛋白,不同亚家族均具有特异的保守基序,但是motif 1和motif 2存在所有八仙花ABC转运蛋白中;将拟南芥129个ABC转运蛋白构建系统发育树,这48个八仙花的ABC转运蛋白分别聚在拟南芥的7个ABC亚家族中。表达谱分析结果发现,铝胁迫处理后HmABCA1、HmABCC1、HmABCC6、HmABCC14和HmABCD1基因在根部上调表达,仅HmABCG1基因在叶片中上调表达。本研究结果为进一步研究八仙花ABC转运蛋白基因的耐铝功能和表达调控提供了参考。