胃癌炎症基因THY1表达及其与肿瘤免疫和上皮-间充质转化的关系

• 全文链接
• 请求原文

作   者：

李兆星;  檀碧波;  张志栋;  刘庆伟;  谭明;  郭洪海;  苑新宇;  王骁;  李勇; 

作者机构：

河北医科大学第四医院; 

关键词：

THY1基因;  上皮-间充质转化;  胃癌;  炎性反应;  肿瘤免疫; 

期刊名称：

中华实验外科杂志

i s s n：

1001-9030

年卷期：

2024 年 41 卷 004 期

页   码：

720-723

摘   要：

目的 基于生物信息学分析方法探讨炎症基因THY1在胃癌中表达、预后价值及其与肿瘤免疫、上皮-间充质转化(EMT)的关系.方法 在癌症基因组图谱数据库(TCGA)中生成胃癌和正常组织数据集,筛选在胃癌中存在差异表达炎症相关基因,采用wilcoxon.test方法识别差异表达基因(DEGs),校正后P<0.05且表达变化超过1.5倍的基因被鉴定为DEGs,确定THY1进行研究.使用R软件的生存分析功能(survival)确定THY1表达的预后评估价值;应用Metascape数据库对THY1功能进行富集分析;在TIMER 2.0数据库研究THY1基因表达与免疫细胞丰度相关性;使用STRING数据库分析与THY1存在互相作用的蛋白质,分析蛋白互作(PPI)结果.取20例新鲜胃癌组织及癌旁组织,使用荧光实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测各基因的mRNA水平.网络数据使用R软件进行生物信息学分析;组织的RT-qPCR检测结果采用配对样本的t检验.结果 162个炎症相关基因中,30个在胃癌组织中表达高于癌旁组织,32个低于癌旁组织(P<0.05),选择THY1为研究基因.THY1在胃癌中表达水平(18.60±1.16)与正常组织(16.98± 1.31)比较,差异有统计学意义(W=10017,P<0.01);根据THY1中位数将患者分为高表达组与低表达组,Kaplan-Meier生存结果显示高表达组中位生存期明显短于低表达组(x2=5.62,P<0.05).对THY1基因功能富集分析结果显示其功能与Ephrin受体信号通路、细胞黏附调节、白细胞介导的细胞毒反应等有关.THY1表达与T细胞CD4+CD8+丰度正相关.应用THY1表达的中位数将样本分组,应用wilcoxon.test识别DEGs并进行GSEA富集分析,结果显示DEGs富集到EMT和炎性反应过程.PPI结果显示,THY1蛋白与纤维连接蛋白1(FN1)、促红细胞生成素产生肝细胞受体A4(EPHA4)等蛋白质存在互作.对临床组织检测结果显示,THY1、FN1、EPHA4的mRNA表达在胃癌组织(4.668±3.449、8.382±2.093、1.647±0.294)均高于癌旁组织(1.005±0.398、1.026±0.131、0.759±0.125),差异有统计学意义(t=4.718、3.508、2.786,P<0.01).结论 THY1基因可能参与免疫反应及EMT过程促进胃癌进展,是新的胃癌治疗潜在靶基因.