云南不同地区蜘蛛兰上朱顶红褪绿环斑病毒RNA S序列分析

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作   者：

高君直;  吴保为;  高雪;  白继龙;  李文贵;  飞进强;  刘雅婷;  李永忠; 

作者机构：

云南红河绿春县农业技术推广中心;  云南高原特色农业产业研究院;  云南农业大学农学与生物技术学院; 

关键词：

朱顶红褪绿环斑病毒;  重组;  蜘蛛兰;  突变;  番茄斑萎病毒属; 

期刊名称：

云南农业大学学报(自然科学)

基金项目：

番茄斑萎病毒属病毒适应性进化研究
植物抗朱顶红褪绿环斑病毒免疫应答机制研究

i s s n：

1004-390X

年卷期：

2017 年 02 期

页   码：

218-225

摘   要：

朱顶红褪绿环斑病毒(Hippeastrum chlorotic ringspot virus,HCRV)是2013年首次发现并报道的番茄斑萎病毒属(Tospovirus)的新种,该病毒可引起蜘蛛兰产生同心环纹、叶片畸形、坏死斑等症状。本研究从云南省不同地区选出6份HCRV单独侵染的蜘蛛兰样本,通过RT-PCR、克隆、转化、测序和拼接,获得6份样本的HCRV分离物RNA S序列。6个分离物S序列长度在2 714~2 747 nt之间,其上编码的非结构蛋白NSs(Nonstructural protein by the S RNA)的NSs基因是1 332 nt,编码N(Nucleocapsid)蛋白的N基因是825 nt。通过生物信息学分析,确定了不同HCRV株系间的关系。同时对S RNA序列及其所编码的非结构蛋白NSs及核壳体蛋白N进行突变和重组分析,确定这6个HCRV分离物的RNA S序列均存在突变和重组事件。结合6个分离物采集地的环境信息,可以看出气候类型、温度等环境差异很大,因此推测云南省多样的气候类型跟HCRV在云南省的广泛分布有关,在这6个HCRV分离物中检测到的快速突变和重组可能是导致HCRV快速适应不同环境,分布范围广泛的原因之一。最后,通过系统进化分析,推测采集自云南省保山市的HLSTCRH是6个HCRV分离物中最先开始进化的,由它分为两个进化支,一支包括玉溪的YN-YX-HT-1和德宏瑞丽的HLS-YNRL-1,另一支包括昆明的HLS-YL,红河的HLS-HHXY以及临沧的HLS-LC-YLHW。