人胸腺基质发育及退化的单细胞转录组分析

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作   者：

李雨晨;  白丽莲;  黄荷凤;  刘欣梅; 

作者机构：

上海交通大学医学院附属国际和平妇幼保健院妇产科上海市胚胎源性疾病重点实验室; 

关键词：

阴性选择;  胸腺基质细胞;  单细胞RNA测序;  基因表达;  发育; 

期刊名称：

上海交通大学学报(医学版)

基金项目：

钙调蛋白复合物ANXA1-S100A11调控胚胎着床和妊娠维持的分子机制研究
Tet3在妊娠前母体高雄激素暴露致子代脂代谢紊乱中的作用研究

i s s n：

1674-8115

年卷期：

2021 年 007 期

页   码：

865-875

摘   要：

目的·探索人类胸腺基质细胞在不同发育阶段的转录动态。方法·利用人类胸腺单细胞转录组数据E-MATB-8581,借助蛋白质相互作用数据库分析不同类型胸腺基质细胞在胚胎期、婴儿期和成人期的分群特点,并计算基因表达差异,结合富集分析推测它们功能变化。结果·相比于树突状细胞,胸腺上皮细胞（thymic epithelial cell,TEC）、内皮细胞（endothelial cell,Endo）和成纤维细胞（fibroblast,Fb）由不同发育阶段造成的基因表达差异更为显著。Ⅰ型髓质TEC （medullary TEC,mTEC）细胞在成年期的抗原提呈功能下降,主要组织相容性复合物（major histocompatibility complex,MHC）Ⅱ类分子表达下调。在出生后的胸腺中,Fb逐渐富集参与T细胞抗原识别、分化和激活的功能。在胚胎期和婴儿期,Endo上调表达的基因主要富集与细胞外基质等相关的通路,而出生后则富集抗原提呈相关通路,并上调2类MHC分子的表达。结论·生物信息学方法揭示了mTEC、Fb和Endo是易受胸腺发育和退化影响的细胞类型。人类胸腺生理性退化可能主要影响T细胞分化中的阴性选择。