I型单纯疱疹病毒感染人二倍体成纤维细胞后长链非编码RNA表达谱分析

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作   者：

邓荣珍;  李志远;  徐梁子;  杞梦迪;  杨梦梅;  孙静;  胡凝珠;  施建东;  胡云章; 

作者机构：

中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所疫苗研究室; 

关键词：

人胚肺二倍体成纤维细胞;  长链非编码RNA;  表达谱;  单纯疱疹病毒1型; 

期刊名称：

中国病原生物学杂志

i s s n：

年卷期：

2020 年 002 期

页   码：

158-163

摘   要：

目的探讨I型单纯疱疹病毒(Herpes simplex virus type 1,HSV-1)感染人胚肺二倍体成纤维细胞(KMB-17)对长链非编码RNAdong non-coding RNAJncRNA)的调控作用.方法用HSV-1感染KMB-17细胞,于感染后48h提取RNA进行高通量测序.测序获得的转录本用Cufflinks.CPC和CNCI软件进行IncRNA的鉴定和注释,并利用cuffdiff软件进行差异表达IncRNA的筛选.对筛选的差异表达IncRNA进行靶基因的预测及其GO和KEGG功能富集分析.结果共筛选到891个差异表达的IncRNA,其中上调515个,下调376个.GO和KEGG功能富集分析表明,HSV-1感染诱导表达差异的IncRNA靶基因主要富集在Toll样受体信号通路,RIG?I样受体信号通路,Jak-STAT信号通路.Hedgehog信号通路、趋化因子信号通路和细胞代谢相关信号通路上.结论HSV-1感染KMB-17细胞后诱导细胞IncRNA差异表达并通过靶基因来影响细胞抗病毒免疫和细胞代谢等相关信号通路,调控细胞抗病毒的响应机制.