橡胶灵芝菌(Ganoderma pseudoferreum)DNA条形码检测筛选(英文)

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作   者：

蔡海滨;  涂敏;  孙爱花;  程汉;  安泽伟;  胡彦师;  李维国; 

作者机构：

中国热带农业科学院橡胶研究所/农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/国家橡胶树育种中心; 

关键词：

鉴定;  橡胶灵芝菌;  ITS;  DNA条形码; 

期刊名称：

热带作物学报

基金项目：

i s s n：

1000-2561

年卷期：

2018 年 011 期

页   码：

2225-2234

摘   要：

选用10对DNA条形码标准序列ITS、COI、nrDNA-LSU、nrDNA-SSU和trnL DNA对海南和云南红根病区分离的21个橡胶灵芝菌进行检测.除COI和trnLDNA外,其他8对引物均扩增得到PCR产物,产物大小范围为268~1355bp,种内相似度为98.05%~99.54%.分别将扩增得到的序列与GenBank公布上的Ganoderma属和常见真菌属序列,共77个ITS、74个nrDNA-LSU和74个nrDNA-SSU序列进行系统进化树构建与分析.结果表明:nrDNA-LSU序列和nrDNA-SSU序列种间差异较小,不能准确区分Ganoderma属及其他属;5对ITS序列均能区分Ganoderma属,但仅ITS1/ITS4序列能将Ganoderma属下16个种归入不同分支.ITS1/ITS4序列表现出适宜的种内与种间差异,适宜作为G. pseudoferreum的DNA条形码.