鸡ApoB基因g.-112A>G单核苷酸多态性的功能性鉴定与分析

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作   者：

陈耀峰;  谢可嘉;  张长超;  王宁;  李辉;  王守志; 

作者机构：

农业部鸡遗传育种重点实验室/黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室/东北农业大学动物科学技术学院; 

关键词：

启动子;  功能性SNP;  鸡(Gallus gallus);  载脂蛋白B基因(ApoB); 

期刊名称：

农业生物技术学报

基金项目：

影响鸡腹脂性状重要基因功能性SNP的鉴定和分析

i s s n：

1674-7968

年卷期：

2018 年 11 期

页   码：

1919-1927

摘   要：

载脂蛋白B (apolipoprotein B, ApoB)在极低密度脂蛋白(very low density lipoproteins, VLDL)组装、转运以及脂类代谢中都具有重要作用。本课题组前期研究发现鸡(Gallus gallus) ApoB基因g.-112A>G单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与鸡腹脂重和腹脂率显著相关。生物信息学分析显示,该SNP位于鸡ApoB基因的启动子区,可能是功能性SNP。为确定该SNP的功能性,本研究开展了该位点不同基因型与血清生化指标的相关分析;比较了ApoB基因3种基因型在鸡肝脏和小肠中的表达水平;构建了含该SNP位点A和G等位基因的启动子报告基因载体,并利用双荧光素酶报告系统分析候选转录因子TATA-box binding protein (TBP)和CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBPα)对该SNP位点不同等位基因荧光素酶活性的影响。关联分析结果显示,携带GG基因型的公鸡高密度脂蛋白(highdensity lipoprotein, HDL)/低密度脂蛋白(low-density lipoprotein, LDL)显著高于AA型个体(P<0.05);qRTPCR结果显示,在鸡肝脏和小肠组织,AG基因型的ApoB基因表达量显著低于AA和GG基因型(P<0.05);报告基因检测结果显示,A等位基因荧光素酶活性显著高于G等位基因(P<0.05)。此外,转录因子TBP和C/EBPα对A等位基因荧光素酶活性的促进作用强于G等位基因(P<0.05)。上述结果提示,ApoB基因g.-112A>G可能是功能性SNP位点,可初步确定其为优质鸡育种的功能性分子标记。本研究为深入探讨ApoB基因在脂肪生长发育中的功能提供了实验数据。