一株雷氏普罗维登斯菌的分离鉴定、生物学特性及其基因组学研究

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作   者：

廖鹏飞;  李论;  柳晨涛;  丁钰杰;  黄秋雅;  胡祎玮;  葛楚天;  徐洁皓;  章晓栋; 

作者机构：

浙江万里学院生物与环境学院;  绍兴文理学院生命与环境科学学院; 

关键词：

鉴定;  雷氏普罗维登斯菌;  药敏实验;  全基因测序;  黄缘闭壳龟;  分离; 

期刊名称：

水生生物学报

i s s n：

1000-3207

年卷期：

2024 年 48 卷 012 期

页   码：

2109-2121

摘   要：

为确定2020年6月浙江杭州一发病黄缘闭壳龟的病原体及病原特征,研究从患病龟肝脏中分离到一株优势菌HZ202006,对该菌进行形态学观察、16S rRNA序列分析、全基因组测序、人工感染实验及药敏试验。结果确认该菌株为雷氏普罗维登斯菌(Providencia rettgeri),短杆状,革兰氏阴性菌。全基因组测序显示该菌株完整基因组序列是由一条4.8 Mb的双链DNA和2个质粒组成。利用耐药基因数据库(CARD)和毒力因子数据库(VFDB)对测序基因进行注释,发现该菌有20个耐药基因和4个毒力因子。药敏试验结果显示, HZ202006只对阿米卡星表现为中度敏感,对青霉素类、头孢类、氨基糖苷类等16种常见的抗生素耐药。研究分离并鉴定了一株使黄缘闭壳龟患病的雷氏普罗维登斯菌,为水产养殖动物防控该菌引起的相关疾病提供参考。