成都地区犬腺病毒2型分子流行病学调查及其纤突基因的生物信息学分析

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作   者：

张发明;  黄坚;  封海波;  李妍;  吉文汇;  卢建远;  黄志宏;  杨晓农; 

作者机构：

西南民族大学生命科学与技术学院; 

关键词：

生物信息学;  遗传变异;  糖基化位点;  纤突基因;  CAV-2);  流行病学调查;  犬腺病毒2型(canine Adenovirus type 2; 

期刊名称：

黑龙江畜牧兽医

基金项目：

煤矿热动力灾害防控技术与装备

i s s n：

年卷期：

2020 年 021 期

页   码：

99-103

摘   要：

为了解成都地区犬腺病毒2型(canine Adenovirus tgpe 2,CAV-2)的流行情况及其纤突基因的遗传变异情况,试验对采集的291份样本(鼻腔样本78份、粪便样本213份)进行PCR检测,利用SPSS软件分析CAV-2感染与犬年龄、性别、免疫情况及季节之间的关系;对CAV-2阳性样本的纤突基因进行全基因扩增,并利用生物信息学软件对其遗传变异情况进行研究.结果表明:在291份样本中,CAV-2阳性率为16.49%(48/291),其中鼻腔样本中CAV-2检出率为17.95%(14/78),粪便样本中CAV-2检出率为15.96%(34/213).6月龄以下的幼龄犬中CAV-2检出率较高,与其他年龄犬只间存在显著差异(P<0.05);免疫完全犬的感染率与未免疫和不完全免疫幼犬间存在极显著差异(P<0.01));CAV-2的感染率无性别、季节等差异(P>0.05).获得的48条CAV-2纤突基因序列与`GenBank中收录的国内外CAV-2毒株之间有较高的核苷酸序列同源性(98.3%~99.9%)和氨基酸序列同源性(98.5%~99.6%);48例阳性样本的核苷酸序列都处于同一CAV-2分支上, CAV-2的纤突蛋白氨基酸序列的糖基化位点都发生在N-Linked糖基化的N-X-T、N-X-S这两种保守序列段中,糖基化位点的数目和位置未发生改变.说明CAV-2纤突基因的遗传性稳定,在成都地区未显示明显变异.